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70周年校庆--中国科技大学龚庆国副教和阮科副教授学术报告

来源:动物医学学院 发布时间:2016-07-31 作者:李棕松 点击:

报告题目:Understanding the mechanism of Hfq-dependent small noncoding RNA regulation of mRNA translation in bacterial stress responses

报告时间:2016年8月2日上午9:30

报 告 人:龚庆国 副教授

报告地点:学院三楼会议室

报告人简介:

龚庆国,1994年毕业于中国科学技术大学材料科学与工程系,获理学学士学位。1997年毕业于中国科学技术大学生物系分子生物学专业,获理学硕士学位。2002 年于香港科技大学生物化学系获得哲学博士学位。

主要工作经历:2003年到2006年和2006年到2008年分别在卡内基梅农大学和匹兹堡大学从事博士后研究。 2008到2009于Bruker Biospin任职美国中大西洋区核磁应用工程师。2009年九月作为“海外人才引进”受聘于中国科技大学生命科学学院任职副教授。2010年获得中科院“引进杰出技术人才”支持。

主要研究兴趣:

1) 非编码RNA的结构功能:主要使用溶液核磁共振方法(NMR)研究重要的非编码RNA的结构并了解其结构功能关系。在体外对RNA进行大规模转录的过程中,使用不同的标记策略(15N,13C,2H)对目标RNA进行稳定同位素标记,进一步使用多维核磁共振实验获取RNA序列和距离信息用于其结构构建。

2) 蛋白-蛋白和蛋白-核酸相互作用:主要使用X-射线晶体衍射技术对基因表达调控中关键的蛋白-蛋白和蛋白-核酸相互作用进行结构表征。对于难以结晶的生物大分子复合物,使用X-射线小角散射结合分子动力学模拟方法获得其结构信息。目前研究体系包括:大肠杆菌RNA分子伴侣Hfq及其与RNA相互作用;tRNA甲基转移酶Trm10与tRNA的相互识别机制等。

在研课题:

国家自然科学基金委面上项目;蛋白质重大研究计划子课题

主要代表论文:

1. Wang Lijun, Wang Weiwei, Li Fudong, Zhang Jihai, Wu Jihui, Gong Qingguo(*),Shi Yunyu(*), Structural insights into the recognition of the internal A-rich linker from OxyS sRNA by Escherichia coli Hfq, Nucleic Acids Research, 2015, 43(4):2400-11

2. Zhao, Debiao, Wang, Xuejuan,Peng, Junhui, Wang, Chongyuan, Li, Fudong, Sun, Qianqian, Zhang, Yibo, Zhang, Jiahai, Cai, Gang, Zuo, Xiaobing, Wu, Jihui, Shi, Yunyu, Zhang, Zhiyong(*), Gong, Qingguo(*), Structural investigation of the interaction between the tandem SH3 domains of c-Cbl-associated protein and vinculin, Journal of Structural Biology, 2014, 187(2): 194-205

3. Zou, Yang, Shao, Zhenhua, Peng, Junhui, Li, Fudong, Gong, Deshun, Wang, Chongyuan, Zuo, Xiaobing, Zhang, Zhiyong, Wu, Jihui, Shi, Yunyu, Gong, Qingguo(*), Crystal structure of triple-BRCT-domain of ECT2 and insights into the binding characteristics to CYK-4, FEBS Letters, 2014, 588(17): 2911-2920

4. Shao, Zhenhua, Yan, Wei, Peng, Junhui, Zuo, Xiaobing, Zou, Yang, Li, Fudong, Gong, Deshun, Ma, Rongsheng, Wu, Jihui, Shi, Yunyu, Zhang, Zhiyong, Teng, Maikun, Li, Xu(*), Gong, Qingguo(*), Crystal structure of tRNA m1G9 methyltransferase Trm10: insight into the catalytic mechanism and recognition of tRNA substrate, Nucleic Acids Research, 2014, 42(1): 509-525

5. Wang, Weiwei, Wang, Lijun, Wu, Jihui, Gong, Qingguo(*), Shi, Yunyu(*), Hfq-bridged ternary complex is important for translation activation of rpoS by DsrA, Nucleic Acids Research, 2013, 41(11): 5938-5948

联系方式:

Tel: 86-551-63607644

e-mail: qgg@ustc.edu.cn

报告题目:Bromodomain的结构与小分子抑制剂研究

报告时间:2016年8月2日上午10:30

报 告 人:阮科 副教授

报告地点:学院三楼会议室

报告人简介:

阮 科,1999 和2002年分别获北京大学化学与分子工程学院本科和硕士学位。2008年获约翰霍普金斯大学博士学位。2008-2010年任职于辉瑞(美国)的药物研发部门。2010年初任英国Beatson癌症研究所Staff Scientist。2011年1月受聘于中国科学技术大学生命科学学院任职副教授,在J. Am. Chem. Soc., Chemical Reviews, PNAS等期刊发表论文20多篇,并多次在实验核磁年会(ENC)、国际磁共振会议(ISMAR)、Pacifichem等国际会议作会议报告。

主要研究兴趣:1)发展和应用现代核磁技术研究蛋白质大复合物的动态结构;2)基于核磁片段筛选发现和鉴定表观遗传关键调控蛋白的活性小分子。

代表性论文:

6. Ruan, K.; Tolman, J. R. "Composite Alignment Media for the Measurement of Independent Sets of NMR Residual Dipolar Couplings". J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 15032-15033.

7. Gebel, E. B.; Ruan, K.; Tolman, J. R.; Shortle, D. "Multiple Alignment Tensors from a Denatured Protein". J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 9310-9311.

8. Tolman, J. R.; Ruan, K. "NMR Residual Dipolar Couplings as Probes of Biomolecular Dynamics". Chem. Rev. 2006, 106, 1720-1736.

9. Ruan, K.; Wang B.-H., Xiao J.-X., et al. "Interfacial tension of aqueous three-phase systems formed by triton X-100/PEG/dextran". J. Disp. Sci. & Tech. 2006, 27, 927-930.

10. Ruan, K.; Briggman, K. B.; Tolman,J. R. "De novo determination of internuclear vector orientations from residual dipolar couplings measured in three independent alignment media". J. Biom. NMR 2008, 41, 61-76.

11. Ruan, K.; Yang, S.; Van Sant K. A.; Likos, J. J. “Application of Hadamard Spectroscopy to Automated Combined Verification in High-throughput NMR”. Magn. Res. Chem. 2009, 47, 693-700.

12. Norcross,J. A.; Milling C. T.; Olson, D. L.; Xu, D.; Audrieth, A.; Albrecht, R.; Ruan, K.; Likos, J.; Jones, C.; Peck, T. L.; “Multiplexed NMR: An Automated CapNMR Dual-Sample Probe”. Anal. Chem. 2010, 82, 7227–7236.

13. He, C; Pillai, S; Taglini, F; Li, FD; Ruan, K; Zhang, JH; Wu, JH; Shi, YY*; Bayne, EH*. “Structural analysis of Stc1 provides insights into the coupling of RNAi and chromatin modification”, PNAS, 2013, 110, 1879-1888.

14. Dai, YN; Chi, CB; Zhou, K; Cheng, W; Jiang, YL; Ren, YM; Ruan, K; Chen, YX; Zhou, CZ*. “Structure and catalytic mechanism of yeast 4-amino-4-deoxychorismate lyase”, J. Bio.l Chem. 2013, 288, 22985-22992.

15. Gao, J; Ma, RS; Wang, W; Wang, N; Sasaki, R; Snyderman, D; Wu, JH; Ruan, K*. “Automated NMR Fragment Based Screening Identified a Novel Interface Blocker to the LARG/RhoA Complex”, PLoS One, 2014, 9, e88098.

16. Liu, ZH; Li, FD; Ruan, K; Zhang, JH; Mei, YD; Wu, JH; Shi, YY*. “Structural and Functional Insights into the Human Borjeson-Forssman-Lehmann Syndrome- associated Protein PHF6”, J. Biol. Chem., 2014, 289, 10069-10083.

17. Ma RS; Li QF; Wang AD; Zhang JH; Liu ZJ; Wu JH; Su XC*, Ruan K*. “Determination of pseudocontact shifts of low-populated excited states by NMR chemical exchange saturation transfer”, Phys. Chem. Chem. Phys. 18:13794-8, 2016 (highlighted in backcover).

18. Wei Q, Chen J, Mi J, Zhang J, Ruan K*, Wu J*. “NMR Backbone Assignment of Large Proteins by Using 13Cα-Only Triple-Resonance Experiments”, Chem. Euro. J. 2016, 22, 9556-64 (highlighted in frontispiece).

19. Wang N, Li F, Bao H, Li J, Wu J, Ruan K*. “NMR Fragment Screening Hit Induces Plasticity of BRD7/9 Bromodomains”, Chembiochem, 2016, doi: 10.1002/cbic. 201600184.

20. Ma RS, Wang PC, Wu J, Ruan K*, “Process of Fragment-Based Lead Discovery-A Perspective from NMR”. Molecules 2016, 21, E854.

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