1904年（清光绪三十年）12月1日，清政府在河北保定创建了北洋陆军马医学堂。

1907年4月，更名为陆军马医学堂。

1912年12月（民国元年），陆军马医学堂奉令改组，定名为陆军兽医学校。

1919年3月，陆军兽医学校与军医学校同时迁往北平（北京）富新仓新校址。

1928年7月，南京国民政府派员接管陆军兽医学校，隶属军政部军医司领导。

1935年12月，兽医学校由北平迁往南京小营原骑兵学校旧址办学，1937年8月19日下午5时许，南京小营遭日本飞机轰炸，同年9月该校向湖南益阳转移。

1938年8月，又由益阳迁至湖南洪江，1939年1月继续向贵州安顺迁移，2月17日到达安顺，即行开课。

1942年在兰州设立西北分校，1946年撤销分校，人员、物资并归安顺兽医学校。

1949年11月18日，贵州省安顺县和平解放，前陆军兽医学校改组为中国人民解放军西南军区兽医学校。1951年10月25日，更名为中国人民解放军第二兽医学校。

1946年7月，在今吉林省白城市组建东北民主联军兽医学校，1947年5月迁往黑龙江 省齐齐哈尔市，1949年4月迁往长春，命名为东北军区（注：本书采用的军区名为各历史 时期的名称）兽医学校。

1949年10月，在北京丰台组建了军委兽医学院，1950年10月17日该院迁往长春，与 东北军区兽医学校合并，仍称军委兽医学院。1951年7月20日，更名为中国人民解放军第一兽医学校（又称中国人民解放军高级兽医学校）。

1946年3月，在江苏淮城组建了华东军区兽医学校，几经变迁后，于1951年10月7日 改名为中国人民解放军第三兽医学校。

1949年10月，在湖北武昌成立华中军区兽医学校，1951年4月更名为中南军区兽医学校，同年10月25日，更名为中国人民解放军第四兽医学校。

1953年1月1日，中共中央军委下达军令字第001号命令，公布了“中国人民解放军兽医大学建校方案及全军兽医人员培训计划”，命令第二、三、四兽医学校于1953年2月20日以前，迁往长春与第一兽医学校合并，组建中国人民解放军兽医大学。 新中国成立初期，在兰州组建的西北军区兽医学校，在完成5年教学任务之后，于1954年12月奉命撤销，部分教师和未毕业的学员转入兽医大学。1956年7月1日，国务院、中央军委决定兽医大学移交农垦部，除军事兽医系全体军人（包括该系领导干部和学员）外，其余有军籍的人员集体转业，更名为长春畜牧兽医大学。

1958年4月北安农学院、长春农学院合并，定名为长春农学院，周恩来总理为该校题写了校名。1959年1月长春农业机械化专科学校并入长春农学院，同年6月更名为吉林农业大学。

1961年11月26日，国务院下达“国增字第190号”文件，同意将1956年军队移交给吉林省的原中国人民解放军兽医大学交还给军队。

1962年1月5日总参谋部、总政治部颁布命令：“中国人民解放军兽医大学从1月1日起，隶属于总后勤部建制领导，为正军级单位。”

1992年8月26日，中央军委颁布命令：“中国人民解放军兽医大学”改建为“中国人民解放军农牧大学。”

1999年4月26日，中央军委主席江泽民签发〔1999〕军字第24号命令，将“中国人民解放军农牧大学”改称“中国人民解放军军需大学。”

2004年8月29日，根据国务院办公厅、中央军委办公厅《关于军需大学等四所军队院校移交归属的复函》《军队院校移交地方工作实施意见》，“中国人民解放军军需大学移交教育部管理，与吉林大学合并，相对独立办学”，同日，举行军需大学移交教育部与吉林大学合并签字仪式。

2004年12月16日，成立吉林大学农学部。